微小免疫細胞単一細胞プロテオミクス

今回紹介するのは、単一細胞プロテオミクスの深度と再現性を大きく押し上げたラベルフリーSCPプラットフォームです。低入力向けに最適化したサンプル前処理、精緻化した液体クロマトグラフィー、そしてOrbitrap Astral Zoom質量分析計を統合し、個々のHeLa細胞から平均で7,000種超のタンパク質を定量化。これまで捉えにくかった低豊度タンパク質も多数カバーし、深度と再現性の両立を示しました(LCの具体的メソッド名は記載なし、Evosep使用の言及もありません)。

本手法を非常に小さな末梢血単核球(PBMC)に適用すると、単一細胞あたり最大約4,000タンパク質を同定し、ヘテロな集団内で単球、T細胞、活性化リンパ球を識別する鍵マーカーも検出。臨床的に重要な一次サンプルに対しても、深い網羅性と精度で機能的ヘテロ性を直接読み解ける段階に到達したことを示しています。

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