確率共鳴による単一細胞プロテオミクスの成功

本研究は、単一細胞プロテオミクスにおける成功の背後にある確率共鳴現象を探求しています。確率共鳴は、信号の線形性を犠牲にしながら、しきい値以下の信号をノイズによって検出する現象です。著者らは、タンデムマスタグ(TMT)を用いてキャリアプロテオームと多重化された単一細胞プロテオームのペプチド信号が、Orbitrap質量分析計において名目上の検出しきい値を下回っていることを示しました。この信号は、確率共鳴の増幅により質量スペクトルに登録され、増幅の程度は0.5〜2.5単一細胞相当であることが明らかになりました。さらに、対応する量の一定の「ペデスタル」プロテオームを添加することで、アナライトの単一細胞プロテオームの信号が検出しきい値を超え、検出能力が向上し、定量の線形性が大幅に回復することが示されました。

  • 確率共鳴により、しきい値以下の信号が検出可能になる。
  • TMTを用いた多重化により、単一細胞プロテオームの信号が増幅される。
  • ペデスタルプロテオームの添加が信号の検出性と定量の線形性を改善する。

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