今回紹介するのは、「乾燥血液からのタンパク質および翻訳後修飾のプロテオミクス解析のための効率的なワークフローの開発と検証」という研究です。この研究では、全血のプロテオミクス解析が精密医療や疾患表現型の評価において重要であることが認識されつつある中、従来の血漿や血清と比較して全血が解析の難しいマトリックスと見なされていることに着目しています。著者らは、20μLの静脈血を用いたボリュメトリック吸収マイクロサンプリングによる新しいワークフローを開発し、トリプシン化、N-グリコペプチドおよびリン酸化ペプチドの濃縮を組み合わせ、煩雑なサンプルの乾燥やクリーンアップを回避しています。
この方法では、約2時間の質量分析(MS)取得時間で最大10,000のアナライト(タンパク質群、グリコペプチド形式、リン酸化部位として報告)を定量化しました。さらに、乾燥血液と湿った血液のプロテオームの安定性や、外因性の炎症刺激やホスファターゼ阻害の影響を探る実験も行われました。多オミクス因子分析を用いることで、血液プロテオームの個体間変動に寄与するアナライトを容易に特定し、特に免疫グロブリン重鎖定数アルファ2アロタイプを区別するN-グリコペプチドが明らかになりました。この研究の成果は、乾燥血液からのタンパク質および翻訳後修飾の統合的なMSベースの定量化の実現可能性とベストプラクティスを確立するための重要な一歩となります。
コメントを残す