今回紹介するのは、単一アリコート・濃縮不要で血漿プロテオームとN型グリコプロテオームを同時に高スループット解析するデュアルオミクス基盤です。上位14種の高豊富性タンパク質を除去後、同一消化試料から23分の狭窓DIAと42分のSCE-DDAを連続実行するペアラン設計により、臨床スループットは約24例/日を達成。1検体あたり3,756±413のタンパク質群と1,226±78のグリコペプチドをカバーし、その中にはFDA承認薬標的が303含まれます。旧世代機とのクロスプラットフォーム比較では、113 PGs/分の速度で10～20倍以上の高速化と、タンパク質量の高い再現性（Pearson r > 0.9）を示し、装置間での移植性を実証しました。

臨床応用では、肺がん・低線量CTで検出された非がん結節・対照を含む300例の血漿解析で、がんと結節間でS100およびアネキシンファミリーに差が見られました。さらに、30例で実施したペアのグリコプロテオミクスでは、FN1、IGHG2、C3、METにおける部位特異的N型糖鎖修飾の変化を、総タンパク量とは独立して検出し、早期肺がん検出に向けた追加の候補バイオマーカーを提示しています。本手法は、深いカバレッジとスケーラビリティ、縦断的再現性を両立し、装置・施設をまたいだ臨床バイオマーカー探索と検証を後押しします。

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