【要約】
SomaScanデータに特化したパスウェイ・エンリッチメント手法「SomaModules」を提案。既存の注釈済み遺伝子セットをもとに、強く相関するSOMAmerモジュールを貪欲法で抽出し、SomaModulesとして構築。MSigDBおよびMitoCarta最新データに基づく40,000以上のSOMAmer対応セットを公開。アルツハイマー病と身体機能の例で検証したところ、従来の遺伝子セットよりも有意に高いGSEAによるエンリッチメントを示し、手法の頑健性も確認。コード・データも公開し、他のカスタムセットへの応用も可能とする。

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jproteome.4c01114