今回紹介するのは、卵巣がんの血漿プロテオミクスで超高感度な候補バイオマーカー探索に挑んだ研究です。著者らは、網羅的なDDAショットガンLC–MS/MSとターゲット指向のMRMに、AFM（原子間力顕微鏡）ベースの濃縮をMSに直結したAFM‑MSを統合し、従来法の検出限界を下回る感度を実現しました。この多プラットフォーム戦略により、卵巣がん進行に関与するタンパク質の拡張リストを血中から作成。MS機種名や具体的なLCメソッド、Evosep使用の有無は抄録では明記されていませんが、AFMによる前処理強化とショットガン/ターゲットの相補性を活かした設計が特徴です。

主な成果として、計371種の関連タンパク質を同定し、その33%はAFM‑MSでのみ検出、26%はメタボロミクスとの関連から見出されました。既報の卵巣がん特異的マーカーに一致するものは6%で、手法の妥当性を裏づけています。さらにATRN、CPN1、APOF、TGM3、CRNNを含む9種の新規候補を提案。高豊度かつ炎症依存性の免疫グロブリン可変領域ペプチドは特異性が低い背景として再分類しています。候補群は血中で10^-12～10^-6 mol/Lの広い濃度域に分布し、本アプローチは従来のプロテオミクスの感度制約を乗り越え、他の多因子性疾患のマーカー探索にも展開可能であることを示しました。

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